栽培食用菌，原料有生料、發酵料、熟料三種處理方式。從生料到發酵料再到熟料，培養料的腐熟程度是由淺到深，營養成分的分解程度是由輕到重，雜菌基數是由多到少，但受外界雜菌的入侵程度是由難到易，從操作方面來講是由簡單到煩瑣，從產量上看是由低到高，生產者應根據自己的情況，合理選擇。

    生料栽培生料栽培即拌料完畢后不經任何處理而直接裝袋接種的栽培方式。顧名思義，培養料是未經腐熟或滅菌的生料。這種栽培方式簡單易行，省工省時，但接種后發菌慢，接種量應大，而且在發菌過程中會造成后發酵，導致高溫燒菌。在炎熱的夏季，高溫多雨，若栽培方法不當，易造成生料酸化腐爛以致栽培失敗。因此，生料栽培僅限于菌絲生長力強的平菇、草菇等。

    發酵料栽培發酵料栽培即是將原料拌勻后，按一定規格要求建堆，進入發酵工藝。當堆溫達一定要求后，進行翻堆，一般要翻3～5次。通過發酵處理，可殺死培養料中的有害微生物和害蟲，但操作麻煩，成本較高。平菇、草菇、雙孢菇、雞腿菇等都很適合發酵料栽培。

    熟料栽培熟料栽培即要對裝袋（瓶）后的培養料進行常壓或高壓滅菌，一方面有利于菌絲體的分解利用，另一方面可殺死培養料中的有害微生物及害蟲。這種栽培方式適用于絕大多數食用菌的栽培，但需要投入大量資金購置滅菌設備和接種設備，而且對栽培技術要求較高。熟料栽培較發酵料更為節省時間，且在時間上較為主動，便于根據人力物力適時進行規模生產，且可大大減少接種量。香菇、杏鮑菇、金針菇、木耳、銀耳等都必須要熟料栽培。