菌渣發(fā)酵需要水分含量在50-60%，水分太多會進(jìn)行無氧發(fā)酵產(chǎn)生有毒物質(zhì)，制作有機(jī)肥和栽培基質(zhì)的時候，會對植株產(chǎn)生毒害，不利于菌渣的有效利用。所以菌渣在夏季汛期堆存和發(fā)酵，縮短發(fā)酵時間、避開雨水對發(fā)酵的影響是發(fā)酵成功的關(guān)鍵。

1、場地選擇：選擇地勢較高，或者將低洼地墊高，防止雨水積水的地方進(jìn)行堆存和發(fā)酵。夏季堆存時設(shè)頂棚或進(jìn)行覆蓋。

2、菌渣預(yù)處理：根據(jù)不同的栽培模式分類處理菌渣，覆土栽培的要去除表層的覆土材料，袋（瓶）栽的采用機(jī)械或人工脫袋（瓶），然后將菌渣粉碎至粒徑2cm以下，混有的硬結(jié)塊、金屬物、塑料膜及布線條等雜物要清除干凈。

3、添加發(fā)酵菌劑：將粉碎的菌渣攤鋪在場地上，將菌劑先與8-10kg物料混勻，然后均勻?yàn)⒃诰砻妫舆m量水后，使菌渣和菌劑充分混勻，調(diào)節(jié)含水量至50-60%左右。

4、建堆：建堆時，建成高1-1.5米，寬不小于1.5米，長度不小于10米的長條垛形發(fā)酵堆，長度根據(jù)原料的多少可以任意調(diào)節(jié)，上面用草苫子覆蓋，保濕保溫。

5、發(fā)酵和翻堆：一般使用翻拋機(jī)或者裝載機(jī)輔助翻堆。建堆后待溫度升至60℃，第一次翻堆以后，每1-3天翻一次堆，隨著料堆升溫速度減慢，翻堆間隔時間適當(dāng)延長。總共翻堆5～6次。

6、發(fā)酵結(jié)束：當(dāng)距離發(fā)酵堆表面30cm處溫度接近環(huán)境溫度、菌渣物料呈深褐色或黑褐色、有輕微菌香味時發(fā)酵完成，發(fā)酵總時間為15d～35d。發(fā)酵結(jié)束后攤堆，充分晾排余熱及廢氣，風(fēng)干后存放。